Kandungan
- Apa itu Genotip dan Fenotip?
- Menjelaskan Genotip HIV
- Menjelaskan Fenoytip HIV
- Bilakah Ujian Rintangan Genetik Dilakukan?
Apabila kegagalan rawatan berlaku, kombinasi ubat alternatif mesti dipilih untuk menekan populasi virus tahan baru ini. Ujian ketahanan genetik membantu memfasilitasi ini dengan mengenal pasti jenis mutasi tahan dalam "kumpulan virus" seseorang, sambil memastikan betapa mudahnya virus tersebut terhadap kemungkinan agen antiretroviral.
Dua alat utama digunakan untuk ujian ketahanan genetik pada HIV: Ujian genotipik HIV dan juga Ujian fenotipik HIV.
Apa itu Genotip dan Fenotip?
Secara definisi, genotip hanyalah susunan genetik organisma, sementara fenotip adalah ciri atau sifat organisma yang dapat dilihat.
Uji genotip (atau genotip) berfungsi dengan mengenal pasti arahan yang diwarisi dalam pengekodan genetik sel, atau DNA. Ujian fenotipik (atau fenotip) mengesahkan ekspresi arahan tersebut di bawah pengaruh keadaan persekitaran yang berbeza.
Walaupun hubungan antara genotip dan fenotip tidak mutlak, genotip sering dapat menjadi ramalan fenotip, terutama ketika perubahan dalam kod genetik memberikan perubahan yang diharapkan pada sifat atau ciri-seperti dalam kes mengembangkan ketahanan terhadap ubat.
Fenotaip, sebaliknya, mengesahkan "di sini-dan-sekarang." Ini bertujuan untuk menilai reaksi organisma terhadap perubahan spesifik dalam tekanan persekitaran-seperti ketika HIV terdedah kepada ubat-ubatan dan / atau kepekatan ubat yang berbeza.
Menjelaskan Genotip HIV
Genotip HIV umumnya merupakan teknologi yang paling biasa digunakan untuk ujian ketahanan. Tujuan ujian ini adalah untuk mengesan mutasi genetik spesifik di gag-pol rantau virus ' genom (atau kod genetik). Ini adalah wilayah di mana enzim transkripase terbalik, protease dan integrase-sasaran kebanyakan ubat antiretroviral-dikodekan pada rantai DNA.
Dengan pertama kali memperkuat genom HIV menggunakan teknologi reaksi berantai polimerase (PCR), juruteknik makmal dapat mengurutkan (atau "memetakan") genetik virus dengan menggunakan pelbagai teknologi pengesanan mutasi.
Mutasi ini (atau pengumpulan mutasi) ditafsirkan oleh juruteknik yang menganalisis hubungan antara mutasi yang dikenal pasti dan kerentanan virus yang diharapkan terhadap ubat antiretroviral yang berbeza. Pangkalan data dalam talian dapat membantu dengan membandingkan urutan ujian dengan prototaip virus "liar-jenis" (iaitu, HIV yang tidak mengandungi mutasi tahan).
Tafsiran ujian ini digunakan untuk menentukan kerentanan ubat, dengan jumlah mutasi utama yang lebih banyak memberikan tahap ketahanan terhadap ubat yang lebih tinggi.
Menjelaskan Fenoytip HIV
Fenotip HIV menilai pertumbuhan HIV seseorang dengan adanya ubat, kemudian membandingkannya dengan pertumbuhan virus kawalan liar yang mempunyai jenis ubat yang sama.
Seperti ujian genotipik, ujian fenotipik menguatkan kawasan gag-pol genom HIV. Bahagian kod genetik ini kemudian "dicantumkan" ke klon jenis liar menggunakan teknologi DNA rekombinan. Virus rekombinan yang dihasilkan digunakan untuk menjangkiti sel mamalia secara in vitro (di makmal).
Sampel virus kemudian terdedah kepada peningkatan kepekatan ubat antiretroviral yang berlainan sehingga penekanan virus 50% dan 90% dicapai. Kepekatannya kemudian dibandingkan dengan hasil dari sampel kawalan liar.
Perubahan "lipatan" relatif memberikan julat nilai yang menentukan kerentanan ubat. Perubahan empat kali ganda bermaksud bahawa empat kali jumlah ubat diperlukan untuk mencapai penindasan virus berbanding dengan jenis liar. Semakin besar nilai lipatannya, semakin tidak mudah dijangkiti virus terhadap ubat tertentu.
Nilai-nilai ini kemudian diletakkan dalam julat klinikal rendah dan klinikal atas, dengan nilai atas memberi tahap ketahanan ubat yang lebih tinggi.
Bilakah Ujian Rintangan Genetik Dilakukan?
Di A.S., ujian ketahanan genetik secara tradisional dilakukan pada pesakit yang belum pernah menjalani rawatan untuk menentukan sama ada mereka mempunyai ketahanan terhadap ubat yang "diperoleh". Kajian di A.S. menunjukkan bahawa antara 6% dan 16% virus yang disebarkan akan tahan terhadap sekurang-kurangnya satu ubat antiretroviral, sementara hampir 5% akan tahan terhadap lebih dari satu kelas ubat.
Ujian ketahanan genetik juga digunakan apabila ketahanan terhadap ubat disyaki pada individu yang menjalani terapi. Ujian dilakukan semasa pesakit sama ada mengambil rejimen yang gagal atau dalam masa empat minggu penamatan rawatan jika viral load lebih besar daripada 500 salinan / mL. Ujian genotipik biasanya lebih disukai dalam keadaan ini kerana harganya lebih murah, mempunyai masa pemulihan yang lebih cepat, dan menawarkan kepekaan yang lebih besar untuk mengesan campuran virus jenis liar dan tahan.
Gabungan ujian fenotipik dan genotipik biasanya disukai bagi orang yang mempunyai ketahanan multi-ubat yang kompleks, terutama bagi mereka yang terdedah kepada perencat protease.